Protein–RNA interactions for Protein: A6NIJ5

FAM90A20P, Putative protein FAM90A20P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A20PA6NIJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM90A20PA6NIJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM90A20PA6NIJ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM90A20PA6NIJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM90A20PA6NIJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A20PA6NIJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM90A20PA6NIJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM90A20PA6NIJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A20PA6NIJ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM90A20PA6NIJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A20PA6NIJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A20PA6NIJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A20PA6NIJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM90A20PA6NIJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM90A20PA6NIJ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM90A20PA6NIJ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms