Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRR23AA6NEV1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRR23AA6NEV1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRR23AA6NEV1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRR23AA6NEV1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRR23AA6NEV1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR23AA6NEV1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRR23AA6NEV1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRR23AA6NEV1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR23AA6NEV1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRR23AA6NEV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRR23AA6NEV1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRR23AA6NEV1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRR23AA6NEV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRR23AA6NEV1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRR23AA6NEV1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRR23AA6NEV1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRR23AA6NEV1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRR23AA6NEV1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRR23AA6NEV1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRR23AA6NEV1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRR23AA6NEV1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRR23AA6NEV1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRR23AA6NEV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRR23AA6NEV1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRR23AA6NEV1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRR23AA6NEV1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRR23AA6NEV1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRR23AA6NEV1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRR23AA6NEV1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRR23AA6NEV1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR23AA6NEV1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR23AA6NEV1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR23AA6NEV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR23AA6NEV1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR23AA6NEV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRR23AA6NEV1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms