Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRTO4Q9UKD2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRTO4Q9UKD2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRTO4Q9UKD2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRTO4Q9UKD2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRTO4Q9UKD2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRTO4Q9UKD2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRTO4Q9UKD2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRTO4Q9UKD2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRTO4Q9UKD2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRTO4Q9UKD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRTO4Q9UKD2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRTO4Q9UKD2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRTO4Q9UKD2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRTO4Q9UKD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRTO4Q9UKD2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRTO4Q9UKD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MRTO4Q9UKD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRTO4Q9UKD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MRTO4Q9UKD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRTO4Q9UKD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRTO4Q9UKD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRTO4Q9UKD2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRTO4Q9UKD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms