Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MRTO4Q9UKD2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MRTO4Q9UKD2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
MRTO4Q9UKD2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MRTO4Q9UKD2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MRTO4Q9UKD2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MRTO4Q9UKD2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MRTO4Q9UKD2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MRTO4Q9UKD2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MRTO4Q9UKD2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRTO4Q9UKD2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MRTO4Q9UKD2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRTO4Q9UKD2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MRTO4Q9UKD2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MRTO4Q9UKD2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MRTO4Q9UKD2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MRTO4Q9UKD2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRTO4Q9UKD2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRTO4Q9UKD2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRTO4Q9UKD2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRTO4Q9UKD2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRTO4Q9UKD2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRTO4Q9UKD2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRTO4Q9UKD2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRTO4Q9UKD2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRTO4Q9UKD2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRTO4Q9UKD2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MRTO4Q9UKD2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MRTO4Q9UKD2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MRTO4Q9UKD2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRTO4Q9UKD2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRTO4Q9UKD2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRTO4Q9UKD2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRTO4Q9UKD2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRTO4Q9UKD2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRTO4Q9UKD2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MRTO4Q9UKD2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRTO4Q9UKD2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRTO4Q9UKD2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRTO4Q9UKD2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRTO4Q9UKD2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRTO4Q9UKD2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRTO4Q9UKD2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRTO4Q9UKD2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRTO4Q9UKD2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRTO4Q9UKD2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MRTO4Q9UKD2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MRTO4Q9UKD2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MRTO4Q9UKD2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MRTO4Q9UKD2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MRTO4Q9UKD2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRTO4Q9UKD2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRTO4Q9UKD2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRTO4Q9UKD2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRTO4Q9UKD2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRTO4Q9UKD2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRTO4Q9UKD2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MRTO4Q9UKD2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MRTO4Q9UKD2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MRTO4Q9UKD2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MRTO4Q9UKD2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MRTO4Q9UKD2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MRTO4Q9UKD2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRTO4Q9UKD2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRTO4Q9UKD2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRTO4Q9UKD2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRTO4Q9UKD2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRTO4Q9UKD2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRTO4Q9UKD2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRTO4Q9UKD2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRTO4Q9UKD2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRTO4Q9UKD2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRTO4Q9UKD2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRTO4Q9UKD2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRTO4Q9UKD2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRTO4Q9UKD2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRTO4Q9UKD2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRTO4Q9UKD2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRTO4Q9UKD2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MRTO4Q9UKD2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRTO4Q9UKD2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRTO4Q9UKD2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRTO4Q9UKD2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRTO4Q9UKD2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRTO4Q9UKD2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRTO4Q9UKD2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRTO4Q9UKD2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MRTO4Q9UKD2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRTO4Q9UKD2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MRTO4Q9UKD2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRTO4Q9UKD2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRTO4Q9UKD2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRTO4Q9UKD2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRTO4Q9UKD2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRTO4Q9UKD2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRTO4Q9UKD2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MRTO4Q9UKD2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MRTO4Q9UKD2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MRTO4Q9UKD2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms