Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DCTN4Q9UJW0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DCTN4Q9UJW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCTN4Q9UJW0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCTN4Q9UJW0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DCTN4Q9UJW0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DCTN4Q9UJW0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DCTN4Q9UJW0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCTN4Q9UJW0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCTN4Q9UJW0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCTN4Q9UJW0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCTN4Q9UJW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCTN4Q9UJW0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCTN4Q9UJW0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCTN4Q9UJW0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCTN4Q9UJW0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCTN4Q9UJW0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCTN4Q9UJW0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCTN4Q9UJW0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCTN4Q9UJW0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCTN4Q9UJW0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCTN4Q9UJW0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCTN4Q9UJW0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCTN4Q9UJW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCTN4Q9UJW0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCTN4Q9UJW0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCTN4Q9UJW0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DCTN4Q9UJW0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCTN4Q9UJW0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DCTN4Q9UJW0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCTN4Q9UJW0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCTN4Q9UJW0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCTN4Q9UJW0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCTN4Q9UJW0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCTN4Q9UJW0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCTN4Q9UJW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCTN4Q9UJW0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCTN4Q9UJW0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCTN4Q9UJW0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCTN4Q9UJW0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCTN4Q9UJW0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCTN4Q9UJW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCTN4Q9UJW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCTN4Q9UJW0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms