Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP53Q9NZM5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP53Q9NZM5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP53Q9NZM5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP53Q9NZM5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP53Q9NZM5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP53Q9NZM5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP53Q9NZM5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP53Q9NZM5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP53Q9NZM5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP53Q9NZM5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP53Q9NZM5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP53Q9NZM5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP53Q9NZM5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP53Q9NZM5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP53Q9NZM5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP53Q9NZM5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP53Q9NZM5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP53Q9NZM5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP53Q9NZM5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP53Q9NZM5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP53Q9NZM5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP53Q9NZM5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP53Q9NZM5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP53Q9NZM5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP53Q9NZM5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP53Q9NZM5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP53Q9NZM5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP53Q9NZM5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP53Q9NZM5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP53Q9NZM5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP53Q9NZM5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP53Q9NZM5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP53Q9NZM5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP53Q9NZM5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOP53Q9NZM5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NOP53Q9NZM5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOP53Q9NZM5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOP53Q9NZM5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms