Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSMCE4AQ9NXX6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMCE4AQ9NXX6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMCE4AQ9NXX6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMCE4AQ9NXX6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMCE4AQ9NXX6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMCE4AQ9NXX6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMCE4AQ9NXX6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMCE4AQ9NXX6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMCE4AQ9NXX6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSMCE4AQ9NXX6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NSMCE4AQ9NXX6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE4AQ9NXX6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE4AQ9NXX6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSMCE4AQ9NXX6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSMCE4AQ9NXX6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NSMCE4AQ9NXX6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NSMCE4AQ9NXX6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NSMCE4AQ9NXX6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMCE4AQ9NXX6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMCE4AQ9NXX6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMCE4AQ9NXX6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSMCE4AQ9NXX6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMCE4AQ9NXX6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMCE4AQ9NXX6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMCE4AQ9NXX6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMCE4AQ9NXX6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMCE4AQ9NXX6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMCE4AQ9NXX6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE4AQ9NXX6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms