Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP4-3Q9BYR4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
KRTAP4-3Q9BYR4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP4-3Q9BYR4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms