Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP4Q9BWG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP4Q9BWG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP4Q9BWG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP4Q9BWG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP4Q9BWG4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP4Q9BWG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSBP4Q9BWG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSBP4Q9BWG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSBP4Q9BWG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSBP4Q9BWG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms