Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EAF1Q96JC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EAF1Q96JC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF1Q96JC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EAF1Q96JC9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EAF1Q96JC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EAF1Q96JC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF1Q96JC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EAF1Q96JC9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF1Q96JC9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EAF1Q96JC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EAF1Q96JC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EAF1Q96JC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EAF1Q96JC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms