Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ULK4Q96C45 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ULK4Q96C45 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ULK4Q96C45 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ULK4Q96C45 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ULK4Q96C45 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ULK4Q96C45 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ULK4Q96C45 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ULK4Q96C45 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ULK4Q96C45 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ULK4Q96C45 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ULK4Q96C45 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ULK4Q96C45 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ULK4Q96C45 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ULK4Q96C45 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ULK4Q96C45 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ULK4Q96C45 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ULK4Q96C45 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms