Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNF148Q8N7C7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF148Q8N7C7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF148Q8N7C7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF148Q8N7C7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF148Q8N7C7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF148Q8N7C7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF148Q8N7C7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF148Q8N7C7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF148Q8N7C7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF148Q8N7C7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF148Q8N7C7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF148Q8N7C7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF148Q8N7C7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF148Q8N7C7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF148Q8N7C7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF148Q8N7C7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF148Q8N7C7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF148Q8N7C7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF148Q8N7C7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF148Q8N7C7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF148Q8N7C7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF148Q8N7C7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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