Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF148Q8N7C7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RNF148Q8N7C7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF148Q8N7C7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RNF148Q8N7C7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RNF148Q8N7C7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF148Q8N7C7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF148Q8N7C7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF148Q8N7C7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF148Q8N7C7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF148Q8N7C7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF148Q8N7C7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RNF148Q8N7C7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RNF148Q8N7C7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RNF148Q8N7C7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RNF148Q8N7C7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF148Q8N7C7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF148Q8N7C7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF148Q8N7C7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF148Q8N7C7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF148Q8N7C7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF148Q8N7C7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF148Q8N7C7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF148Q8N7C7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF148Q8N7C7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF148Q8N7C7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF148Q8N7C7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF148Q8N7C7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF148Q8N7C7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RNF148Q8N7C7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RNF148Q8N7C7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF148Q8N7C7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF148Q8N7C7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF148Q8N7C7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF148Q8N7C7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF148Q8N7C7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF148Q8N7C7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF148Q8N7C7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF148Q8N7C7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF148Q8N7C7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF148Q8N7C7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF148Q8N7C7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF148Q8N7C7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF148Q8N7C7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF148Q8N7C7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF148Q8N7C7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF148Q8N7C7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF148Q8N7C7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF148Q8N7C7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF148Q8N7C7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF148Q8N7C7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF148Q8N7C7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF148Q8N7C7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF148Q8N7C7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RNF148Q8N7C7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF148Q8N7C7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF148Q8N7C7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF148Q8N7C7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF148Q8N7C7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF148Q8N7C7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF148Q8N7C7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF148Q8N7C7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF148Q8N7C7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF148Q8N7C7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF148Q8N7C7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF148Q8N7C7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF148Q8N7C7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF148Q8N7C7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF148Q8N7C7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF148Q8N7C7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF148Q8N7C7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF148Q8N7C7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF148Q8N7C7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF148Q8N7C7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF148Q8N7C7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF148Q8N7C7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF148Q8N7C7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF148Q8N7C7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF148Q8N7C7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF148Q8N7C7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF148Q8N7C7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF148Q8N7C7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF148Q8N7C7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF148Q8N7C7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF148Q8N7C7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF148Q8N7C7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF148Q8N7C7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF148Q8N7C7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF148Q8N7C7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF148Q8N7C7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF148Q8N7C7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF148Q8N7C7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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