Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00528Q8N1L1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00528Q8N1L1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00528Q8N1L1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00528Q8N1L1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00528Q8N1L1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00528Q8N1L1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00528Q8N1L1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00528Q8N1L1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00528Q8N1L1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00528Q8N1L1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms