Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF220Q5VTB9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF220Q5VTB9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF220Q5VTB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF220Q5VTB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF220Q5VTB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF220Q5VTB9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF220Q5VTB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF220Q5VTB9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF220Q5VTB9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF220Q5VTB9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF220Q5VTB9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF220Q5VTB9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF220Q5VTB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF220Q5VTB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF220Q5VTB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF220Q5VTB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF220Q5VTB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF220Q5VTB9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF220Q5VTB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF220Q5VTB9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF220Q5VTB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RNF220Q5VTB9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF220Q5VTB9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF220Q5VTB9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF220Q5VTB9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF220Q5VTB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF220Q5VTB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms