Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms