Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TBRG1Q3YBR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBRG1Q3YBR2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TBRG1Q3YBR2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TBRG1Q3YBR2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBRG1Q3YBR2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBRG1Q3YBR2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TBRG1Q3YBR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TBRG1Q3YBR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBRG1Q3YBR2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBRG1Q3YBR2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBRG1Q3YBR2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBRG1Q3YBR2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBRG1Q3YBR2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBRG1Q3YBR2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TBRG1Q3YBR2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBRG1Q3YBR2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TBRG1Q3YBR2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBRG1Q3YBR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBRG1Q3YBR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBRG1Q3YBR2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TBRG1Q3YBR2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBRG1Q3YBR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBRG1Q3YBR2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBRG1Q3YBR2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBRG1Q3YBR2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBRG1Q3YBR2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBRG1Q3YBR2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms