Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX1Q16384 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX1Q16384 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX1Q16384 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX1Q16384 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX1Q16384 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX1Q16384 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX1Q16384 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX1Q16384 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSX1Q16384 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SSX1Q16384 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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