Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPTEP56180 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPTEP56180 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPTEP56180 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPTEP56180 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPTEP56180 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPTEP56180 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPTEP56180 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TPTEP56180 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTEP56180 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPTEP56180 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPTEP56180 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTEP56180 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTEP56180 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPTEP56180 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTEP56180 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPTEP56180 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPTEP56180 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TPTEP56180 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TPTEP56180 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPTEP56180 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TPTEP56180 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPTEP56180 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TPTEP56180 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TPTEP56180 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TPTEP56180 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TPTEP56180 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPTEP56180 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPTEP56180 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPTEP56180 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPTEP56180 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPTEP56180 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPTEP56180 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPTEP56180 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPTEP56180 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPTEP56180 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPTEP56180 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPTEP56180 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPTEP56180 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPTEP56180 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPTEP56180 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPTEP56180 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPTEP56180 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPTEP56180 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPTEP56180 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPTEP56180 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPTEP56180 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TPTEP56180 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TPTEP56180 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TPTEP56180 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPTEP56180 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPTEP56180 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPTEP56180 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TPTEP56180 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPTEP56180 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPTEP56180 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPTEP56180 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPTEP56180 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPTEP56180 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPTEP56180 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPTEP56180 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPTEP56180 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPTEP56180 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPTEP56180 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPTEP56180 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPTEP56180 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPTEP56180 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPTEP56180 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPTEP56180 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPTEP56180 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPTEP56180 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPTEP56180 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPTEP56180 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPTEP56180 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPTEP56180 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPTEP56180 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPTEP56180 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPTEP56180 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPTEP56180 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPTEP56180 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPTEP56180 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPTEP56180 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPTEP56180 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPTEP56180 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPTEP56180 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTEP56180 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTEP56180 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPTEP56180 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTEP56180 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTEP56180 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPTEP56180 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTEP56180 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTEP56180 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTEP56180 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTEP56180 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTEP56180 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPTEP56180 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTEP56180 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTEP56180 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTEP56180 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.7 ms