Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3BGRP55822 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH3BGRP55822 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BGRP55822 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BGRP55822 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BGRP55822 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BGRP55822 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BGRP55822 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BGRP55822 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BGRP55822 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BGRP55822 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BGRP55822 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BGRP55822 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BGRP55822 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BGRP55822 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BGRP55822 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BGRP55822 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRP55822 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BGRP55822 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BGRP55822 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BGRP55822 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BGRP55822 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BGRP55822 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BGRP55822 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BGRP55822 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BGRP55822 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms