Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLNS1AP54105 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLNS1AP54105 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLNS1AP54105 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLNS1AP54105 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLNS1AP54105 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLNS1AP54105 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLNS1AP54105 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLNS1AP54105 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLNS1AP54105 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLNS1AP54105 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLNS1AP54105 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLNS1AP54105 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLNS1AP54105 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLNS1AP54105 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLNS1AP54105 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLNS1AP54105 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLNS1AP54105 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLNS1AP54105 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLNS1AP54105 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLNS1AP54105 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLNS1AP54105 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLNS1AP54105 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLNS1AP54105 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLNS1AP54105 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLNS1AP54105 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLNS1AP54105 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLNS1AP54105 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLNS1AP54105 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLNS1AP54105 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLNS1AP54105 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLNS1AP54105 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms