Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNN1P51911 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNN1P51911 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN1P51911 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNN1P51911 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNN1P51911 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNN1P51911 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNN1P51911 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNN1P51911 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN1P51911 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN1P51911 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN1P51911 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN1P51911 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN1P51911 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNN1P51911 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNN1P51911 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNN1P51911 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNN1P51911 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNN1P51911 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN1P51911 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN1P51911 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNN1P51911 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNN1P51911 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNN1P51911 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNN1P51911 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNN1P51911 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNN1P51911 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN1P51911 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN1P51911 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN1P51911 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN1P51911 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN1P51911 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN1P51911 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN1P51911 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN1P51911 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN1P51911 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN1P51911 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN1P51911 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN1P51911 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN1P51911 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN1P51911 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN1P51911 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN1P51911 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN1P51911 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN1P51911 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN1P51911 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN1P51911 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN1P51911 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNN1P51911 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNN1P51911 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNN1P51911 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNN1P51911 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN1P51911 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNN1P51911 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN1P51911 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNN1P51911 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNN1P51911 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN1P51911 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN1P51911 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNN1P51911 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNN1P51911 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNN1P51911 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNN1P51911 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN1P51911 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNN1P51911 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN1P51911 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNN1P51911 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN1P51911 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNN1P51911 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN1P51911 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNN1P51911 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN1P51911 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNN1P51911 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN1P51911 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN1P51911 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN1P51911 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNN1P51911 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN1P51911 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNN1P51911 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN1P51911 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN1P51911 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNN1P51911 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN1P51911 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN1P51911 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNN1P51911 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN1P51911 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN1P51911 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNN1P51911 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNN1P51911 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN1P51911 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNN1P51911 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNN1P51911 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN1P51911 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN1P51911 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN1P51911 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNN1P51911 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN1P51911 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNN1P51911 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNN1P51911 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNN1P51911 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms