Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBP2P50120 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RBP2P50120 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RBP2P50120 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP2P50120 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP2P50120 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RBP2P50120 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP2P50120 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP2P50120 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP2P50120 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP2P50120 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP2P50120 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP2P50120 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP2P50120 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP2P50120 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP2P50120 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP2P50120 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP2P50120 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP2P50120 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP2P50120 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP2P50120 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP2P50120 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP2P50120 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP2P50120 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP2P50120 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP2P50120 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP2P50120 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP2P50120 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP2P50120 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP2P50120 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP2P50120 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP2P50120 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP2P50120 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP2P50120 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP2P50120 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP2P50120 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP2P50120 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP2P50120 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP2P50120 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP2P50120 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP2P50120 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP2P50120 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP2P50120 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP2P50120 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBP2P50120 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBP2P50120 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP2P50120 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBP2P50120 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBP2P50120 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBP2P50120 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBP2P50120 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP2P50120 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP2P50120 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBP2P50120 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP2P50120 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBP2P50120 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBP2P50120 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP2P50120 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP2P50120 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBP2P50120 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP2P50120 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBP2P50120 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP2P50120 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBP2P50120 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP2P50120 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP2P50120 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP2P50120 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP2P50120 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP2P50120 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP2P50120 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP2P50120 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP2P50120 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP2P50120 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP2P50120 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP2P50120 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP2P50120 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP2P50120 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP2P50120 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP2P50120 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP2P50120 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP2P50120 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP2P50120 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP2P50120 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP2P50120 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP2P50120 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP2P50120 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP2P50120 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP2P50120 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP2P50120 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP2P50120 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP2P50120 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP2P50120 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP2P50120 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP2P50120 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP2P50120 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP2P50120 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP2P50120 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP2P50120 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP2P50120 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP2P50120 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms