Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDIT3P35638 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DDIT3P35638 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDIT3P35638 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDIT3P35638 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDIT3P35638 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDIT3P35638 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDIT3P35638 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDIT3P35638 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDIT3P35638 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDIT3P35638 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDIT3P35638 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDIT3P35638 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDIT3P35638 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DDIT3P35638 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
DDIT3P35638 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDIT3P35638 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDIT3P35638 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDIT3P35638 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDIT3P35638 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DDIT3P35638 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDIT3P35638 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDIT3P35638 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDIT3P35638 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDIT3P35638 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDIT3P35638 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDIT3P35638 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
DDIT3P35638 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDIT3P35638 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDIT3P35638 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
DDIT3P35638 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDIT3P35638 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDIT3P35638 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDIT3P35638 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDIT3P35638 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDIT3P35638 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDIT3P35638 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
DDIT3P35638 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DDIT3P35638 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
DDIT3P35638 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDIT3P35638 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DDIT3P35638 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDIT3P35638 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DDIT3P35638 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDIT3P35638 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DDIT3P35638 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
DDIT3P35638 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DDIT3P35638 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DDIT3P35638 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DDIT3P35638 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DDIT3P35638 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
DDIT3P35638 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms