Protein–RNA interactions for Protein: P35548

MSX2, Homeobox protein MSX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX2P35548 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSX2P35548 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSX2P35548 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSX2P35548 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSX2P35548 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSX2P35548 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSX2P35548 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSX2P35548 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSX2P35548 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSX2P35548 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSX2P35548 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MSX2P35548 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MSX2P35548 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSX2P35548 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSX2P35548 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSX2P35548 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSX2P35548 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSX2P35548 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSX2P35548 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSX2P35548 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSX2P35548 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSX2P35548 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSX2P35548 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSX2P35548 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSX2P35548 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSX2P35548 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSX2P35548 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MSX2P35548 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MSX2P35548 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MSX2P35548 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MSX2P35548 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MSX2P35548 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MSX2P35548 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSX2P35548 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSX2P35548 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSX2P35548 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSX2P35548 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSX2P35548 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSX2P35548 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MSX2P35548 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSX2P35548 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSX2P35548 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MSX2P35548 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSX2P35548 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSX2P35548 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MSX2P35548 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSX2P35548 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSX2P35548 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSX2P35548 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MSX2P35548 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSX2P35548 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MSX2P35548 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSX2P35548 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MSX2P35548 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSX2P35548 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSX2P35548 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSX2P35548 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSX2P35548 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSX2P35548 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSX2P35548 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSX2P35548 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MSX2P35548 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSX2P35548 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSX2P35548 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MSX2P35548 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSX2P35548 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSX2P35548 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSX2P35548 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSX2P35548 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSX2P35548 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSX2P35548 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSX2P35548 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSX2P35548 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSX2P35548 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSX2P35548 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSX2P35548 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSX2P35548 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSX2P35548 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSX2P35548 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSX2P35548 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSX2P35548 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSX2P35548 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSX2P35548 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSX2P35548 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSX2P35548 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSX2P35548 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSX2P35548 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSX2P35548 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSX2P35548 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSX2P35548 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSX2P35548 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSX2P35548 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSX2P35548 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSX2P35548 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSX2P35548 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSX2P35548 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSX2P35548 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSX2P35548 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSX2P35548 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSX2P35548 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms