Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTMSP20962 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTMSP20962 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTMSP20962 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTMSP20962 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTMSP20962 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTMSP20962 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTMSP20962 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTMSP20962 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PTMSP20962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTMSP20962 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTMSP20962 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTMSP20962 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTMSP20962 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTMSP20962 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTMSP20962 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTMSP20962 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTMSP20962 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PTMSP20962 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTMSP20962 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTMSP20962 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTMSP20962 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTMSP20962 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTMSP20962 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTMSP20962 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTMSP20962 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTMSP20962 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTMSP20962 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTMSP20962 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTMSP20962 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTMSP20962 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTMSP20962 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTMSP20962 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTMSP20962 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTMSP20962 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTMSP20962 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTMSP20962 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTMSP20962 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTMSP20962 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTMSP20962 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTMSP20962 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTMSP20962 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTMSP20962 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTMSP20962 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTMSP20962 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PTMSP20962 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTMSP20962 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTMSP20962 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTMSP20962 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTMSP20962 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTMSP20962 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTMSP20962 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTMSP20962 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTMSP20962 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTMSP20962 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTMSP20962 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTMSP20962 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTMSP20962 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTMSP20962 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTMSP20962 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTMSP20962 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTMSP20962 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTMSP20962 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTMSP20962 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTMSP20962 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTMSP20962 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTMSP20962 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTMSP20962 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTMSP20962 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTMSP20962 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTMSP20962 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTMSP20962 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTMSP20962 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTMSP20962 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTMSP20962 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTMSP20962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTMSP20962 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTMSP20962 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTMSP20962 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTMSP20962 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTMSP20962 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTMSP20962 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTMSP20962 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTMSP20962 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTMSP20962 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
PTMSP20962 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms