Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB6P18564 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB6P18564 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB6P18564 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB6P18564 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB6P18564 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB6P18564 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB6P18564 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB6P18564 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB6P18564 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB6P18564 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB6P18564 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB6P18564 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB6P18564 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB6P18564 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB6P18564 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms