Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGB6P18564 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGB6P18564 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGB6P18564 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ITGB6P18564 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ITGB6P18564 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITGB6P18564 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ITGB6P18564 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITGB6P18564 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITGB6P18564 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ITGB6P18564 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITGB6P18564 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITGB6P18564 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGB6P18564 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGB6P18564 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGB6P18564 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB6P18564 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB6P18564 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITGB6P18564 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ITGB6P18564 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGB6P18564 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITGB6P18564 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGB6P18564 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGB6P18564 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGB6P18564 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB6P18564 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB6P18564 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB6P18564 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB6P18564 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB6P18564 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB6P18564 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB6P18564 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGB6P18564 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB6P18564 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB6P18564 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGB6P18564 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB6P18564 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB6P18564 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB6P18564 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB6P18564 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB6P18564 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGB6P18564 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB6P18564 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB6P18564 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGB6P18564 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGB6P18564 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB6P18564 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB6P18564 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB6P18564 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ITGB6P18564 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGB6P18564 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB6P18564 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB6P18564 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGB6P18564 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB6P18564 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB6P18564 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB6P18564 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB6P18564 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB6P18564 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB6P18564 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB6P18564 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB6P18564 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB6P18564 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB6P18564 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB6P18564 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB6P18564 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB6P18564 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB6P18564 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB6P18564 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB6P18564 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB6P18564 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB6P18564 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB6P18564 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB6P18564 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB6P18564 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB6P18564 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGB6P18564 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGB6P18564 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGB6P18564 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGB6P18564 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGB6P18564 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGB6P18564 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB6P18564 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGB6P18564 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGB6P18564 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGB6P18564 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGB6P18564 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB6P18564 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGB6P18564 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGB6P18564 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGB6P18564 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB6P18564 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB6P18564 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB6P18564 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB6P18564 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB6P18564 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGB6P18564 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB6P18564 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB6P18564 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB6P18564 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms