Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VCLP18206 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCLP18206 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCLP18206 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCLP18206 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCLP18206 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCLP18206 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VCLP18206 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCLP18206 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VCLP18206 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VCLP18206 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCLP18206 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VCLP18206 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VCLP18206 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCLP18206 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCLP18206 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VCLP18206 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCLP18206 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VCLP18206 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCLP18206 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCLP18206 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCLP18206 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VCLP18206 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCLP18206 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VCLP18206 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VCLP18206 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VCLP18206 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VCLP18206 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VCLP18206 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VCLP18206 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCLP18206 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCLP18206 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCLP18206 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCLP18206 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCLP18206 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VCLP18206 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCLP18206 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCLP18206 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCLP18206 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCLP18206 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCLP18206 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCLP18206 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCLP18206 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCLP18206 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCLP18206 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCLP18206 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCLP18206 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCLP18206 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCLP18206 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCLP18206 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCLP18206 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCLP18206 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VCLP18206 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VCLP18206 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCLP18206 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCLP18206 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCLP18206 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VCLP18206 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VCLP18206 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCLP18206 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VCLP18206 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCLP18206 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCLP18206 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VCLP18206 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VCLP18206 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VCLP18206 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VCLP18206 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VCLP18206 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VCLP18206 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VCLP18206 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCLP18206 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCLP18206 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VCLP18206 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VCLP18206 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VCLP18206 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCLP18206 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VCLP18206 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCLP18206 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCLP18206 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCLP18206 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VCLP18206 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCLP18206 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VCLP18206 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VCLP18206 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCLP18206 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VCLP18206 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCLP18206 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VCLP18206 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VCLP18206 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VCLP18206 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCLP18206 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VCLP18206 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCLP18206 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCLP18206 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCLP18206 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCLP18206 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCLP18206 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCLP18206 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCLP18206 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCLP18206 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms