Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB6P17509 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB6P17509 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB6P17509 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB6P17509 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB6P17509 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB6P17509 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB6P17509 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB6P17509 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB6P17509 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB6P17509 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB6P17509 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB6P17509 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB6P17509 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB6P17509 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB6P17509 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB6P17509 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB6P17509 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB6P17509 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB6P17509 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB6P17509 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB6P17509 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB6P17509 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB6P17509 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB6P17509 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXB6P17509 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXB6P17509 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB6P17509 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms