Protein–RNA interactions for Protein: O95238

SPDEF, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDEFO95238 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPDEFO95238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDEFO95238 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDEFO95238 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDEFO95238 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDEFO95238 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDEFO95238 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDEFO95238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDEFO95238 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDEFO95238 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPDEFO95238 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPDEFO95238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDEFO95238 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDEFO95238 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPDEFO95238 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDEFO95238 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPDEFO95238 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDEFO95238 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPDEFO95238 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPDEFO95238 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPDEFO95238 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms