Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEBLO76041 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NEBLO76041 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEBLO76041 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEBLO76041 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEBLO76041 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEBLO76041 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEBLO76041 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEBLO76041 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEBLO76041 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEBLO76041 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEBLO76041 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEBLO76041 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEBLO76041 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEBLO76041 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEBLO76041 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEBLO76041 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEBLO76041 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEBLO76041 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NEBLO76041 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEBLO76041 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEBLO76041 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEBLO76041 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEBLO76041 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEBLO76041 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEBLO76041 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEBLO76041 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEBLO76041 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEBLO76041 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEBLO76041 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEBLO76041 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEBLO76041 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEBLO76041 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEBLO76041 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEBLO76041 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEBLO76041 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEBLO76041 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEBLO76041 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NEBLO76041 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEBLO76041 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEBLO76041 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEBLO76041 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEBLO76041 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEBLO76041 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEBLO76041 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEBLO76041 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEBLO76041 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEBLO76041 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEBLO76041 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEBLO76041 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEBLO76041 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEBLO76041 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEBLO76041 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEBLO76041 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEBLO76041 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEBLO76041 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEBLO76041 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEBLO76041 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEBLO76041 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEBLO76041 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEBLO76041 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEBLO76041 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEBLO76041 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEBLO76041 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEBLO76041 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEBLO76041 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEBLO76041 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEBLO76041 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEBLO76041 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEBLO76041 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEBLO76041 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEBLO76041 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEBLO76041 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEBLO76041 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEBLO76041 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEBLO76041 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEBLO76041 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEBLO76041 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEBLO76041 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEBLO76041 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEBLO76041 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEBLO76041 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NEBLO76041 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEBLO76041 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEBLO76041 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEBLO76041 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEBLO76041 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEBLO76041 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEBLO76041 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEBLO76041 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEBLO76041 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEBLO76041 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEBLO76041 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEBLO76041 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEBLO76041 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEBLO76041 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEBLO76041 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEBLO76041 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEBLO76041 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEBLO76041 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms