Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRMUO75648 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRMUO75648 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRMUO75648 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMUO75648 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMUO75648 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRMUO75648 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMUO75648 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRMUO75648 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRMUO75648 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRMUO75648 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMUO75648 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMUO75648 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRMUO75648 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMUO75648 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMUO75648 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMUO75648 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRMUO75648 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRMUO75648 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMUO75648 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRMUO75648 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRMUO75648 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRMUO75648 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRMUO75648 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRMUO75648 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRMUO75648 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRMUO75648 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRMUO75648 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMUO75648 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRMUO75648 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMUO75648 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMUO75648 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRMUO75648 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRMUO75648 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMUO75648 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMUO75648 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRMUO75648 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRMUO75648 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMUO75648 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRMUO75648 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMUO75648 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMUO75648 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMUO75648 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMUO75648 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRMUO75648 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMUO75648 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMUO75648 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRMUO75648 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMUO75648 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMUO75648 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMUO75648 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMUO75648 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMUO75648 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMUO75648 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMUO75648 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMUO75648 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMUO75648 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMUO75648 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMUO75648 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMUO75648 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMUO75648 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMUO75648 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMUO75648 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMUO75648 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMUO75648 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMUO75648 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMUO75648 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMUO75648 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMUO75648 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMUO75648 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMUO75648 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMUO75648 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMUO75648 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMUO75648 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMUO75648 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMUO75648 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMUO75648 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMUO75648 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMUO75648 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMUO75648 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMUO75648 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMUO75648 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMUO75648 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMUO75648 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMUO75648 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMUO75648 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMUO75648 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMUO75648 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMUO75648 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMUO75648 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMUO75648 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMUO75648 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMUO75648 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMUO75648 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMUO75648 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMUO75648 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRMUO75648 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRMUO75648 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMUO75648 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRMUO75648 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms