Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM90A7PA6NKC0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM90A7PA6NKC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM90A7PA6NKC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM90A7PA6NKC0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM90A7PA6NKC0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM90A7PA6NKC0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM90A7PA6NKC0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM90A7PA6NKC0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM90A7PA6NKC0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM90A7PA6NKC0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms