Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG2

TRBV6-6, T-cell receptor beta variable 6-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms