Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG2

TRBV6-6, T-cell receptor beta variable 6-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBV6-6A0A0A6YYG2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRBV6-6A0A0A6YYG2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBV6-6A0A0A6YYG2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBV6-6A0A0A6YYG2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV6-6A0A0A6YYG2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV6-6A0A0A6YYG2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV6-6A0A0A6YYG2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV6-6A0A0A6YYG2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV6-6A0A0A6YYG2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV6-6A0A0A6YYG2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV6-6A0A0A6YYG2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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