Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEIKINA0A087WXM9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEIKINA0A087WXM9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEIKINA0A087WXM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEIKINA0A087WXM9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MEIKINA0A087WXM9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEIKINA0A087WXM9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIKINA0A087WXM9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIKINA0A087WXM9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIKINA0A087WXM9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEIKINA0A087WXM9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIKINA0A087WXM9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIKINA0A087WXM9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIKINA0A087WXM9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms