Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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