Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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