Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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