Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ABCF3-207ENST00000468892 1360 ntTSL 315.04■□□□□ -01e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 VARS2-206ENST00000473916 2000 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TYMS-206ENST00000584122 534 ntTSL 414.03□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ABCF3-214ENST00000480562 1182 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ZNF277-202ENST00000361946 1736 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 VARS2-207ENST00000476162 2228 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 NDUFA2-202ENST00000502960 721 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ABCF3-206ENST00000466742 2331 ntTSL 212.03□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.89□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 511.26□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 510.69□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 NDUFA2-203ENST00000510680 576 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 59.65□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 35.4
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SUB1P53999 NDUFA2-204ENST00000512088 627 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.85□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 EXOSC1-203ENST00000370886 741 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 EXOSC1-202ENST00000370885 718 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TSNAX-DISC1-201ENST00000602567 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.04□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 EXOSC1-204ENST00000370902 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TSNAX-201ENST00000366639 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 USP16-206ENST00000485067 2259 ntTSL 27.32□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TSNAX-203ENST00000475168 5629 ntTSL 26.42□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ZMAT2-202ENST00000506644 735 ntTSL 36.2□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 NKAP-203ENST00000477789 2345 ntTSL 25.73□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.651e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 TPR-203ENST00000467810 581 ntTSL 24.49□□□□□ -1.691e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 EIF3F-203ENST00000528763 609 ntTSL 23.86□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 CRLS1-205ENST00000478846 687 ntTSL 23.69□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.867e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 ZNF277-204ENST00000421864 651 ntTSL 33.34□□□□□ -1.873e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 USP16-205ENST00000474835 3835 ntTSL 1 (best)3.01□□□□□ -1.931e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.021e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.091e-7■■■■■ 35.4
SUB1P53999 HPF1-203ENST00000515204 548 ntTSL 21.46□□□□□ -2.181e-7■■■■■ 35.4
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SUB1P53999 SLC25A5-204ENST00000475354 483 ntTSL 58.22□□□□□ -1.096e-44■■■■■ 35.3
SUB1P53999 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 35.3
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SUB1P53999 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.63e-7■■■■■ 35.3
SUB1P53999 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 35.3
SUB1P53999 MRPS33-206ENST00000484502 466 ntTSL 33.58□□□□□ -1.843e-7■■■■■ 35.3
SUB1P53999 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.863e-7■■■■■ 35.3
SUB1P53999 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.334e-9■■■■■ 35.3
SUB1P53999 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 35.2
SUB1P53999 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 35.2
SUB1P53999 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 35.2
SUB1P53999 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 35.2
SUB1P53999 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 35.2
SUB1P53999 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 RPS6KB2-209ENST00000528964 1806 ntTSL 514.46□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 RPS6KB2-205ENST00000525088 5528 ntTSL 213.13□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC11A-205ENST00000558217 882 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC11A-210ENST00000560409 819 ntTSL 35.41□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 216.53■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.88e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.998e-7■■■■■ 35.1
SUB1P53999 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 35.1
SUB1P53999 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 35
SUB1P53999 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 35
SUB1P53999 SEC61G-202ENST00000395535 459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 35
SUB1P53999 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 35
SUB1P53999 SYF2-203ENST00000474160 438 ntTSL 214.46□□□□□ -0.098e-8■■■■■ 35
SUB1P53999 AC106795.1-204ENST00000506672 1570 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 34.9
SUB1P53999 AC106795.1-207ENST00000507037 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 34.9
SUB1P53999 AC106795.1-211ENST00000358442 515 ntTSL 56.53□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 34.9
SUB1P53999 AC106795.1-212ENST00000514635 250 ntTSL 50.74□□□□□ -2.294e-7■■■■■ 34.9
SUB1P53999 NOLC1-204ENST00000464969 2288 ntTSL 28.91□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 34.9
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