RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312629.9

RPS6KB2-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KB2, Length 1,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2-201ENST00000312629 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.15■■■■■ 4.82
RPS6KB2-201ENST00000312629 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.81■■■■□ 3.96
RPS6KB2-201ENST00000312629 ABCC9O60706 1549 aa38.15■■■■□ 3.7
RPS6KB2-201ENST00000312629 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
RPS6KB2-201ENST00000312629 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.44■■■■□ 3.58
RPS6KB2-201ENST00000312629 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.4■■■■□ 3.58
RPS6KB2-201ENST00000312629 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.26■■■■□ 3.55
RPS6KB2-201ENST00000312629 NACADO15069 1562 aa37.22■■■■□ 3.55
RPS6KB2-201ENST00000312629 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.07■■■■□ 3.53
RPS6KB2-201ENST00000312629 SCRIBQ14160 1630 aa36.39■■■■□ 3.42
RPS6KB2-201ENST00000312629 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.25■■■■□ 3.39
RPS6KB2-201ENST00000312629 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.19■■■■□ 3.38
RPS6KB2-201ENST00000312629 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.89■■■■□ 3.34
RPS6KB2-201ENST00000312629 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.32
RPS6KB2-201ENST00000312629 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.07■■■■□ 3.2
RPS6KB2-201ENST00000312629 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
RPS6KB2-201ENST00000312629 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
RPS6KB2-201ENST00000312629 SMARCA4P51532 1647 aa34.88■■■■□ 3.17
RPS6KB2-201ENST00000312629 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.81■■■■□ 3.16
RPS6KB2-201ENST00000312629 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
RPS6KB2-201ENST00000312629 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.55■■■■□ 3.12
RPS6KB2-201ENST00000312629 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.52■■■■□ 3.12
RPS6KB2-201ENST00000312629 WIZO95785 1651 aa34.5■■■■□ 3.11
RPS6KB2-201ENST00000312629 SMARCA2P51531 1590 aa34.49■■■■□ 3.11
RPS6KB2-201ENST00000312629 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
RPS6KB2-201ENST00000312629 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.46■■■■□ 3.11
RPS6KB2-201ENST00000312629 NCAPD3P42695 1498 aa34.32■■■■□ 3.08
RPS6KB2-201ENST00000312629 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
RPS6KB2-201ENST00000312629 HMGXB3Q12766 1538 aa34.24■■■■□ 3.07
RPS6KB2-201ENST00000312629 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.22■■■■□ 3.07
RPS6KB2-201ENST00000312629 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
RPS6KB2-201ENST00000312629 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.77■■■■□ 3
RPS6KB2-201ENST00000312629 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.37■■■□□ 2.93
RPS6KB2-201ENST00000312629 CFTRP13569 1480 aa33.34■■■□□ 2.93
RPS6KB2-201ENST00000312629 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.31■■■□□ 2.92
RPS6KB2-201ENST00000312629 NESP48681 1621 aa33.24■■■□□ 2.91
RPS6KB2-201ENST00000312629 PRDM2Q13029 1718 aa33.21■■■□□ 2.91
RPS6KB2-201ENST00000312629 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.05■■■□□ 2.88
RPS6KB2-201ENST00000312629 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.99■■■□□ 2.87
RPS6KB2-201ENST00000312629 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.91■■■□□ 2.86
RPS6KB2-201ENST00000312629 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.88■■■□□ 2.85
RPS6KB2-201ENST00000312629 ERCC6Q03468 1493 aa32.84■■■□□ 2.85
RPS6KB2-201ENST00000312629 ABCC8Q09428 1581 aa32.8■■■□□ 2.84
RPS6KB2-201ENST00000312629 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.73■■■□□ 2.83
RPS6KB2-201ENST00000312629 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.65■■■□□ 2.82
RPS6KB2-201ENST00000312629 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.65■■■□□ 2.82
RPS6KB2-201ENST00000312629 CUX1P39880 1505 aa32.61■■■□□ 2.81
RPS6KB2-201ENST00000312629 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.6■■■□□ 2.81
RPS6KB2-201ENST00000312629 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
RPS6KB2-201ENST00000312629 SYNJ1O43426 1573 aa32.59■■■□□ 2.81
RPS6KB2-201ENST00000312629 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.81
RPS6KB2-201ENST00000312629 TOP2BQ02880 1626 aa32.57■■■□□ 2.8
RPS6KB2-201ENST00000312629 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.56■■■□□ 2.8
RPS6KB2-201ENST00000312629 TOPBP1Q92547 1522 aa32.56■■■□□ 2.8
RPS6KB2-201ENST00000312629 TRIM41Q8WV44 630 aa32.55■■■□□ 2.8
RPS6KB2-201ENST00000312629 WDR62O43379 1518 aa32.52■■■□□ 2.8
RPS6KB2-201ENST00000312629 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.38■■■□□ 2.77
RPS6KB2-201ENST00000312629 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
RPS6KB2-201ENST00000312629 SOGA1O94964 1423 aa32.23■■■□□ 2.75
RPS6KB2-201ENST00000312629 CUX2O14529 1486 aa32.2■■■□□ 2.75
RPS6KB2-201ENST00000312629 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.18■■■□□ 2.74
RPS6KB2-201ENST00000312629 IFT140Q96RY7 1462 aa32.15■■■□□ 2.74
RPS6KB2-201ENST00000312629 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
RPS6KB2-201ENST00000312629 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.11■■■□□ 2.73
RPS6KB2-201ENST00000312629 WDR97A6NE52 1622 aa32.08■■■□□ 2.73
RPS6KB2-201ENST00000312629 KIF27Q86VH2 1401 aa31.98■■■□□ 2.71
RPS6KB2-201ENST00000312629 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
RPS6KB2-201ENST00000312629 EEA1Q15075 1411 aa31.93■■■□□ 2.7
RPS6KB2-201ENST00000312629 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.92■■■□□ 2.7
RPS6KB2-201ENST00000312629 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
RPS6KB2-201ENST00000312629 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.91■■■□□ 2.7
RPS6KB2-201ENST00000312629 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.87■■■□□ 2.69
RPS6KB2-201ENST00000312629 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
RPS6KB2-201ENST00000312629 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.86■■■□□ 2.697e-7■■■■■ 34.5
RPS6KB2-201ENST00000312629 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
RPS6KB2-201ENST00000312629 PBRM1Q86U86 1689 aa31.77■■■□□ 2.68
RPS6KB2-201ENST00000312629 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.75■■■□□ 2.67
RPS6KB2-201ENST00000312629 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.75■■■□□ 2.67
RPS6KB2-201ENST00000312629 GRIN2BQ13224 1484 aa31.75■■■□□ 2.67
RPS6KB2-201ENST00000312629 IGF1RP08069 1367 aa31.73■■■□□ 2.67
RPS6KB2-201ENST00000312629 CUL7Q14999 1698 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS6KB2-201ENST00000312629 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.59■■■□□ 2.65
RPS6KB2-201ENST00000312629 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
RPS6KB2-201ENST00000312629 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS6KB2-201ENST00000312629 PRXQ9BXM0 1461 aa31.56■■■□□ 2.64
RPS6KB2-201ENST00000312629 ADAMTS12P58397 1594 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KB2-201ENST00000312629 KIF21BO75037 1637 aa31.53■■■□□ 2.64
RPS6KB2-201ENST00000312629 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.53■■■□□ 2.64
RPS6KB2-201ENST00000312629 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.49■■■□□ 2.63
RPS6KB2-201ENST00000312629 SYNJ2O15056 1496 aa31.45■■■□□ 2.62
RPS6KB2-201ENST00000312629 GOLGA3Q08378 1498 aa31.42■■■□□ 2.62
RPS6KB2-201ENST00000312629 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
RPS6KB2-201ENST00000312629 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.37■■■□□ 2.61
RPS6KB2-201ENST00000312629 FBLN2P98095 1184 aa31.35■■■□□ 2.61
RPS6KB2-201ENST00000312629 GRIN2AQ12879 1464 aa31.34■■■□□ 2.61
RPS6KB2-201ENST00000312629 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.32■■■□□ 2.6
RPS6KB2-201ENST00000312629 CHD1O14646 1710 aa31.31■■■□□ 2.6
RPS6KB2-201ENST00000312629 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
RPS6KB2-201ENST00000312629 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.17■■■□□ 2.58
RPS6KB2-201ENST00000312629 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms