RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378863.8

CRLS1-201, Transcript of cardiolipin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRLS1, Length 3,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CRLS1-201ENST00000378863 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.83■■□□□ 1.41
CRLS1-201ENST00000378863 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.76■■□□□ 1.39
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CRLS1-201ENST00000378863 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
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CRLS1-201ENST00000378863 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CRLS1-201ENST00000378863 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CRLS1-201ENST00000378863 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.63■■□□□ 1.21
CRLS1-201ENST00000378863 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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CRLS1-201ENST00000378863 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.26■■□□□ 1.15
CRLS1-201ENST00000378863 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.25■■□□□ 1.15
CRLS1-201ENST00000378863 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.22■■□□□ 1.15
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CRLS1-201ENST00000378863 WIZO95785 1651 aa22■■□□□ 1.11
CRLS1-201ENST00000378863 ABCC8Q09428 1581 aa21.89■■□□□ 1.1
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CRLS1-201ENST00000378863 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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CRLS1-201ENST00000378863 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CRLS1-201ENST00000378863 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
CRLS1-201ENST00000378863 CEP162Q5TB80 1403 aa21.66■■□□□ 1.06
CRLS1-201ENST00000378863 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.6■■□□□ 1.05
CRLS1-201ENST00000378863 FBLN2P98095 1184 aa21.59■■□□□ 1.05
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CRLS1-201ENST00000378863 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CRLS1-201ENST00000378863 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CRLS1-201ENST00000378863 SMARCA2P51531 1590 aa21.3■■□□□ 1
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CRLS1-201ENST00000378863 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CRLS1-201ENST00000378863 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.24■□□□□ 0.99
CRLS1-201ENST00000378863 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CRLS1-201ENST00000378863 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.2■□□□□ 0.98
CRLS1-201ENST00000378863 KIF27Q86VH2 1401 aa21.2■□□□□ 0.98
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CRLS1-201ENST00000378863 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.89■□□□□ 0.94
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CRLS1-201ENST00000378863 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.78■□□□□ 0.92
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