Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2not detected
SUB1P53999 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86not detected
SUB1P53999 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81not detected
SUB1P53999 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78not detected
SUB1P53999 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77not detected
SUB1P53999 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76not detected
SUB1P53999 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72not detected
SUB1P53999 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7not detected
SUB1P53999 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69not detected
SUB1P53999 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68not detected
SUB1P53999 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.661e-12■■□□□ 11.6
SUB1P53999 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64not detected
SUB1P53999 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.61e-7■■■■□ 20.1
SUB1P53999 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6not detected
SUB1P53999 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59not detected
SUB1P53999 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59not detected
SUB1P53999 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59not detected
SUB1P53999 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57not detected
SUB1P53999 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56not detected
SUB1P53999 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56not detected
SUB1P53999 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56not detected
SUB1P53999 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-10■■■■■ 69.7
SUB1P53999 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 18.2
SUB1P53999 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52not detected
SUB1P53999 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51not detected
SUB1P53999 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51not detected
SUB1P53999 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5not detected
SUB1P53999 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47not detected
SUB1P53999 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47not detected
SUB1P53999 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46not detected
SUB1P53999 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46not detected
SUB1P53999 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46not detected
SUB1P53999 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46not detected
SUB1P53999 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46not detected
SUB1P53999 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46not detected
SUB1P53999 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46not detected
SUB1P53999 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45not detected
SUB1P53999 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44not detected
SUB1P53999 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42not detected
SUB1P53999 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42not detected
SUB1P53999 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42not detected
SUB1P53999 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42not detected
SUB1P53999 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41not detected
SUB1P53999 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.43e-9■□□□□ 9
SUB1P53999 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4not detected
SUB1P53999 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.392e-6■■■□□ 15.9
SUB1P53999 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39not detected
SUB1P53999 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39not detected
SUB1P53999 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39not detected
SUB1P53999 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38not detected
SUB1P53999 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37not detected
SUB1P53999 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37not detected
SUB1P53999 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37not detected
SUB1P53999 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37not detected
SUB1P53999 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36not detected
SUB1P53999 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36not detected
SUB1P53999 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.352e-7■□□□□ 11.2
SUB1P53999 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33not detected
SUB1P53999 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33not detected
SUB1P53999 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33not detected
SUB1P53999 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32not detected
SUB1P53999 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32not detected
SUB1P53999 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32not detected
SUB1P53999 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.317e-61■■■■■ 73.9
SUB1P53999 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31not detected
SUB1P53999 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31not detected
SUB1P53999 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31not detected
SUB1P53999 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31not detected
SUB1P53999 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3not detected
SUB1P53999 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3not detected
SUB1P53999 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 30.8
SUB1P53999 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29not detected
SUB1P53999 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29not detected
SUB1P53999 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29not detected
SUB1P53999 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.292e-13■■■■■ 87.1
SUB1P53999 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.284e-8■■□□□ 13.5
SUB1P53999 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28not detected
SUB1P53999 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28not detected
SUB1P53999 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28not detected
SUB1P53999 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28not detected
SUB1P53999 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28not detected
SUB1P53999 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28not detected
SUB1P53999 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27not detected
SUB1P53999 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27not detected
SUB1P53999 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27not detected
SUB1P53999 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27not detected
SUB1P53999 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27not detected
SUB1P53999 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26not detected
SUB1P53999 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.261e-6■■■□□ 18.3
SUB1P53999 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26not detected
SUB1P53999 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25not detected
SUB1P53999 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25not detected
SUB1P53999 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25not detected
SUB1P53999 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25not detected
SUB1P53999 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25not detected
SUB1P53999 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25not detected
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms