Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SUB1P53999 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 238
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SUB1P53999 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-21■■■■■ 150.6
SUB1P53999 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.594e-21■■■■■ 150.6
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SUB1P53999 RPL13-206ENST00000472354 631 ntTSL 38.72□□□□□ -1.014e-21■■■■■ 150.6
SUB1P53999 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 150.6
SUB1P53999 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.451e-323■■■■■ 149.4
SUB1P53999 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.418e-8■■■■■ 143.1
SUB1P53999 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 29.91□□□□□ -0.828e-8■■■■■ 143.1
SUB1P53999 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 143.1
SUB1P53999 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.178e-8■■■■■ 143.1
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SUB1P53999 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.24e-19■■■■■ 137.6
SUB1P53999 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.833e-61■■■■■ 137.5
SUB1P53999 GRHPR-204ENST00000480596 1893 ntTSL 214.8□□□□□ -0.041e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 GRHPR-209ENST00000494290 1593 ntTSL 511.78□□□□□ -0.521e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 GRHPR-210ENST00000497693 4762 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 212.7□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 136
SUB1P53999 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 136
SUB1P53999 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.75□□□□□ -0.538e-25■■■■■ 136
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