Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLSCR3Q9NRY6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLSCR3Q9NRY6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLSCR3Q9NRY6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLSCR3Q9NRY6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLSCR3Q9NRY6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLSCR3Q9NRY6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLSCR3Q9NRY6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLSCR3Q9NRY6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLSCR3Q9NRY6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLSCR3Q9NRY6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLSCR3Q9NRY6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLSCR3Q9NRY6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLSCR3Q9NRY6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLSCR3Q9NRY6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLSCR3Q9NRY6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLSCR3Q9NRY6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLSCR3Q9NRY6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLSCR3Q9NRY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLSCR3Q9NRY6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLSCR3Q9NRY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLSCR3Q9NRY6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLSCR3Q9NRY6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLSCR3Q9NRY6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLSCR3Q9NRY6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLSCR3Q9NRY6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLSCR3Q9NRY6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLSCR3Q9NRY6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLSCR3Q9NRY6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLSCR3Q9NRY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLSCR3Q9NRY6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLSCR3Q9NRY6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLSCR3Q9NRY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLSCR3Q9NRY6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLSCR3Q9NRY6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLSCR3Q9NRY6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLSCR3Q9NRY6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLSCR3Q9NRY6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLSCR3Q9NRY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLSCR3Q9NRY6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLSCR3Q9NRY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLSCR3Q9NRY6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLSCR3Q9NRY6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLSCR3Q9NRY6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLSCR3Q9NRY6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLSCR3Q9NRY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLSCR3Q9NRY6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLSCR3Q9NRY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLSCR3Q9NRY6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLSCR3Q9NRY6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLSCR3Q9NRY6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLSCR3Q9NRY6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLSCR3Q9NRY6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLSCR3Q9NRY6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms