Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM138Q9NPI0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM138Q9NPI0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM138Q9NPI0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM138Q9NPI0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM138Q9NPI0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM138Q9NPI0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM138Q9NPI0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM138Q9NPI0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM138Q9NPI0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM138Q9NPI0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM138Q9NPI0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM138Q9NPI0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM138Q9NPI0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM138Q9NPI0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM138Q9NPI0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM138Q9NPI0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM138Q9NPI0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM138Q9NPI0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM138Q9NPI0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM138Q9NPI0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM138Q9NPI0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM138Q9NPI0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM138Q9NPI0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM138Q9NPI0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM138Q9NPI0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM138Q9NPI0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM138Q9NPI0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM138Q9NPI0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM138Q9NPI0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM138Q9NPI0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM138Q9NPI0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM138Q9NPI0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM138Q9NPI0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM138Q9NPI0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM138Q9NPI0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM138Q9NPI0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM138Q9NPI0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM138Q9NPI0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms