Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC4Q9NPD3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC4Q9NPD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC4Q9NPD3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC4Q9NPD3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC4Q9NPD3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC4Q9NPD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC4Q9NPD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC4Q9NPD3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC4Q9NPD3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC4Q9NPD3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC4Q9NPD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC4Q9NPD3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC4Q9NPD3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EXOSC4Q9NPD3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC4Q9NPD3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EXOSC4Q9NPD3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EXOSC4Q9NPD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC4Q9NPD3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC4Q9NPD3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EXOSC4Q9NPD3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EXOSC4Q9NPD3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC4Q9NPD3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC4Q9NPD3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EXOSC4Q9NPD3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC4Q9NPD3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EXOSC4Q9NPD3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EXOSC4Q9NPD3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC4Q9NPD3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC4Q9NPD3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC4Q9NPD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC4Q9NPD3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC4Q9NPD3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC4Q9NPD3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC4Q9NPD3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC4Q9NPD3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC4Q9NPD3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC4Q9NPD3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC4Q9NPD3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC4Q9NPD3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC4Q9NPD3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC4Q9NPD3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC4Q9NPD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC4Q9NPD3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC4Q9NPD3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC4Q9NPD3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC4Q9NPD3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC4Q9NPD3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC4Q9NPD3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC4Q9NPD3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXOSC4Q9NPD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC4Q9NPD3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC4Q9NPD3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC4Q9NPD3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC4Q9NPD3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC4Q9NPD3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC4Q9NPD3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC4Q9NPD3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC4Q9NPD3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC4Q9NPD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC4Q9NPD3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC4Q9NPD3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.1 ms