Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX6-2Q9C056 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX6-2Q9C056 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX6-2Q9C056 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX6-2Q9C056 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX6-2Q9C056 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX6-2Q9C056 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX6-2Q9C056 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX6-2Q9C056 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX6-2Q9C056 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX6-2Q9C056 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX6-2Q9C056 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX6-2Q9C056 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX6-2Q9C056 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX6-2Q9C056 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX6-2Q9C056 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX6-2Q9C056 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX6-2Q9C056 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX6-2Q9C056 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX6-2Q9C056 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX6-2Q9C056 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX6-2Q9C056 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX6-2Q9C056 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX6-2Q9C056 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX6-2Q9C056 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX6-2Q9C056 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX6-2Q9C056 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX6-2Q9C056 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX6-2Q9C056 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX6-2Q9C056 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX6-2Q9C056 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKX6-2Q9C056 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX6-2Q9C056 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX6-2Q9C056 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX6-2Q9C056 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX6-2Q9C056 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms