Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GABARAPL3Q9BY60 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABARAPL3Q9BY60 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABARAPL3Q9BY60 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GABARAPL3Q9BY60 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GABARAPL3Q9BY60 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GABARAPL3Q9BY60 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABARAPL3Q9BY60 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GABARAPL3Q9BY60 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GABARAPL3Q9BY60 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABARAPL3Q9BY60 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABARAPL3Q9BY60 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABARAPL3Q9BY60 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABARAPL3Q9BY60 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABARAPL3Q9BY60 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABARAPL3Q9BY60 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABARAPL3Q9BY60 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABARAPL3Q9BY60 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABARAPL3Q9BY60 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABARAPL3Q9BY60 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABARAPL3Q9BY60 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABARAPL3Q9BY60 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABARAPL3Q9BY60 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABARAPL3Q9BY60 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABARAPL3Q9BY60 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABARAPL3Q9BY60 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABARAPL3Q9BY60 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABARAPL3Q9BY60 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABARAPL3Q9BY60 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABARAPL3Q9BY60 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABARAPL3Q9BY60 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABARAPL3Q9BY60 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABARAPL3Q9BY60 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABARAPL3Q9BY60 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABARAPL3Q9BY60 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABARAPL3Q9BY60 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABARAPL3Q9BY60 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABARAPL3Q9BY60 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABARAPL3Q9BY60 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABARAPL3Q9BY60 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABARAPL3Q9BY60 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABARAPL3Q9BY60 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABARAPL3Q9BY60 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABARAPL3Q9BY60 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABARAPL3Q9BY60 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABARAPL3Q9BY60 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABARAPL3Q9BY60 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABARAPL3Q9BY60 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABARAPL3Q9BY60 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABARAPL3Q9BY60 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GABARAPL3Q9BY60 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABARAPL3Q9BY60 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABARAPL3Q9BY60 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABARAPL3Q9BY60 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABARAPL3Q9BY60 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABARAPL3Q9BY60 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABARAPL3Q9BY60 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABARAPL3Q9BY60 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABARAPL3Q9BY60 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABARAPL3Q9BY60 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABARAPL3Q9BY60 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABARAPL3Q9BY60 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABARAPL3Q9BY60 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABARAPL3Q9BY60 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms