Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMSS1Q9BQ75 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMSS1Q9BQ75 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMSS1Q9BQ75 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMSS1Q9BQ75 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMSS1Q9BQ75 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMSS1Q9BQ75 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMSS1Q9BQ75 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMSS1Q9BQ75 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CMSS1Q9BQ75 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CMSS1Q9BQ75 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CMSS1Q9BQ75 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CMSS1Q9BQ75 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CMSS1Q9BQ75 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMSS1Q9BQ75 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMSS1Q9BQ75 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMSS1Q9BQ75 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMSS1Q9BQ75 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMSS1Q9BQ75 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMSS1Q9BQ75 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMSS1Q9BQ75 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CMSS1Q9BQ75 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CMSS1Q9BQ75 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMSS1Q9BQ75 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMSS1Q9BQ75 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMSS1Q9BQ75 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMSS1Q9BQ75 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMSS1Q9BQ75 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMSS1Q9BQ75 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMSS1Q9BQ75 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CMSS1Q9BQ75 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMSS1Q9BQ75 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMSS1Q9BQ75 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms